Η νέα αστυνομική ηγεσία, παρότι τον έκρινε διατηρητέο στον βαθμό του, του πρότεινε να μετακινηθεί στον Κλάδο Διοικητικής Υποστήριξης και Ανθρώπινου Δυναμικού του Αρχηγείου της ΕΛ.ΑΣ. ως προϊστάμενος. Ο Μανώλης Σφακιανάκης αρνήθηκε να αφήσει την υπηρεσία που ο ίδιος με δουλειά 20 ετών ανέδειξε, καθώς ουσιαστικά θα επρόκειτο για μία κίνηση «αδρανοποίησης» του δραστήριου στρατηγού. Σύμφωνα με πληροφορίες, ήδη υπαρχουν αντιδράσεις και ενστάσεις για αυτή τη μετακίνηση, χωρίς κανένας να αποκλείει το ενδεχόμενο η νέα ηγεσία να πάρει πίσω την απόφαση της για τη μετακίνηση του Μανώλη Σφακιανακη.